在现代东京的霓虹光影下，忍者与极道的百年战火从未停息。这场宿怨始于1657年明历大火的硝烟中——江户守护者神赛惨蔵与极道之祖幡随院长兵卫的生死对决，至今仍在暗巷中延续。极道既是社会边缘人的避风港，也是罪恶温床，因而成为忍者肃清的目标。竹本组幕后掌权者辉村极道为剿灭忍者，不惜使用禁忌药物“地狱回数券”强化体能，在都市制造连环骚乱。当帝都八忍成员在袭击中陨落，多仲忍者与同伴们燃起复仇烈焰。而看似普通的高中生忍叶与精英白领极美，却因《公主系列》动画结下奇妙友谊。